一、化学性质不同。
根据化学性质区分，聚丙烯酰胺是一种有机高分子聚合物；聚合氯化铝是一种无机高分子聚合物。
二、外观不同。
聚丙烯酰胺无论是阴离子还是阳离子还是非离子，无论是固体还是液体，外观都是白色的干粉或乳液；聚合氯化铝根据含量的高低呈现为褐色、浅褐色、黄色，铝含量越高，颜色越浅。
三、作用机理不同。
聚合氯化铝作为水处理药剂，主要是利用的电中和作用将废水中的小颗粒悬浮物混凝到一起，压缩扩散层而使胶体脱稳；聚丙烯酰胺主要是利用它的吸附架桥特性形成更大更紧密的絮凝团，使絮凝团沉淀或上浮。
四、添加顺序不同。
聚合氯化铝和聚丙烯酰胺经常出现在同一污水处理工艺流程中，他们添加的时期是不一样的，也就是说不能混合添加；当废水或污水的污浊度比较低时或处理的废水中悬浮物或杂质粒径在50μm以下的时候，我们应先添加聚合氯化铝，过30秒左右再添加聚丙烯酰胺助凝；反之，则先添加聚丙烯酰胺，再添加聚合氯化铝。
五、保存时间不同。
在干燥通风密封条件下，
聚丙烯酰胺干粉的保存时间在2年，乳液保存期为6个月；聚合氯化铝保存时间为1年。
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